Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01654 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01654 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
P01654 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01654 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01654 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01654 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01654 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01654 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01654 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01654 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01654 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01654 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01654 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P01654 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01654 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01654 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01654 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01654 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01654 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01654 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01654 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01654 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01654 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01654 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01654 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01654 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01654 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01654 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P01654 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01654 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01654 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01654 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01654 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01654 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01654 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01654 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01654 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01654 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01654 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01654 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01654 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01654 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01654 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01654 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01654 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01654 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01654 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01654 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01654 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P01654 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01654 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01654 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01654 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01654 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01654 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P01654 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01654 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01654 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01654 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01654 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01654 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01654 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01654 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01654 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01654 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01654 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01654 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01654 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01654 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P01654 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01654 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01654 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01654 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P01654 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01654 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01654 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01654 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01654 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01654 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01654 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
P01654 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01654 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P01654 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01654 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01654 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01654 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01654 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01654 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01654 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01654 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01654 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01654 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01654 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01654 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01654 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01654 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01654 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01654 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01654 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms