Protein–RNA interactions for Protein: O88572

Lrp6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp6O88572 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrp6O88572 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrp6O88572 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrp6O88572 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms