Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms