Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nid2O88322 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nid2O88322 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nid2O88322 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nid2O88322 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nid2O88322 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nid2O88322 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nid2O88322 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nid2O88322 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nid2O88322 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nid2O88322 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms