Protein–RNA interactions for Protein: O88319

Ntsr1, Neurotensin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntsr1O88319 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntsr1O88319 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ntsr1O88319 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms