Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms