Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb5O70309 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms