Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lnx1O70263 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms