Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1bO70237 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfi1bO70237 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 467.4 ms