Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf5O70191 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atf5O70191 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atf5O70191 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atf5O70191 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atf5O70191 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atf5O70191 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf5O70191 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atf5O70191 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf5O70191 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms