Protein–RNA interactions for Protein: O55242

Sigmar1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sigmar1O55242 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms