Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sap18O55128 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sap18O55128 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sap18O55128 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sap18O55128 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap18O55128 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap18O55128 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap18O55128 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap18O55128 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap18O55128 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap18O55128 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap18O55128 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap18O55128 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap18O55128 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap18O55128 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sap18O55128 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sap18O55128 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sap18O55128 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sap18O55128 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sap18O55128 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sap18O55128 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sap18O55128 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms