Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LatO54957 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LatO54957 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LatO54957 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LatO54957 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LatO54957 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LatO54957 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LatO54957 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LatO54957 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LatO54957 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LatO54957 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LatO54957 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LatO54957 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LatO54957 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LatO54957 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LatO54957 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LatO54957 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LatO54957 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LatO54957 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LatO54957 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LatO54957 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LatO54957 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LatO54957 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LatO54957 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LatO54957 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LatO54957 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LatO54957 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LatO54957 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LatO54957 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LatO54957 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LatO54957 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LatO54957 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LatO54957 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LatO54957 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LatO54957 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LatO54957 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LatO54957 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LatO54957 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LatO54957 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LatO54957 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LatO54957 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LatO54957 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LatO54957 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LatO54957 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LatO54957 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LatO54957 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LatO54957 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LatO54957 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LatO54957 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LatO54957 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LatO54957 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LatO54957 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LatO54957 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LatO54957 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LatO54957 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LatO54957 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LatO54957 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LatO54957 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LatO54957 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LatO54957 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LatO54957 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LatO54957 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LatO54957 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LatO54957 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LatO54957 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LatO54957 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LatO54957 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LatO54957 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LatO54957 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LatO54957 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LatO54957 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LatO54957 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LatO54957 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LatO54957 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LatO54957 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LatO54957 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LatO54957 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LatO54957 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LatO54957 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LatO54957 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LatO54957 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LatO54957 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LatO54957 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LatO54957 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LatO54957 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LatO54957 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LatO54957 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LatO54957 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LatO54957 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LatO54957 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LatO54957 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LatO54957 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LatO54957 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LatO54957 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LatO54957 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LatO54957 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LatO54957 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LatO54957 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LatO54957 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LatO54957 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms