Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NlkO54949 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NlkO54949 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NlkO54949 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NlkO54949 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NlkO54949 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NlkO54949 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NlkO54949 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NlkO54949 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NlkO54949 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NlkO54949 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NlkO54949 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NlkO54949 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NlkO54949 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NlkO54949 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NlkO54949 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NlkO54949 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NlkO54949 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NlkO54949 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NlkO54949 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NlkO54949 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NlkO54949 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NlkO54949 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NlkO54949 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NlkO54949 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NlkO54949 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NlkO54949 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NlkO54949 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NlkO54949 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NlkO54949 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NlkO54949 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NlkO54949 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NlkO54949 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NlkO54949 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NlkO54949 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NlkO54949 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NlkO54949 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NlkO54949 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NlkO54949 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NlkO54949 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NlkO54949 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NlkO54949 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NlkO54949 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NlkO54949 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NlkO54949 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NlkO54949 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NlkO54949 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NlkO54949 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NlkO54949 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NlkO54949 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NlkO54949 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NlkO54949 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms