Protein–RNA interactions for Protein: O54732

Mmp15, Matrix metalloproteinase-15, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp15O54732 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp15O54732 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp15O54732 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms