Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EdaO54693 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EdaO54693 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EdaO54693 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EdaO54693 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EdaO54693 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EdaO54693 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EdaO54693 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EdaO54693 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EdaO54693 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EdaO54693 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EdaO54693 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EdaO54693 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EdaO54693 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EdaO54693 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EdaO54693 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EdaO54693 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EdaO54693 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EdaO54693 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EdaO54693 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EdaO54693 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EdaO54693 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EdaO54693 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EdaO54693 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EdaO54693 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EdaO54693 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EdaO54693 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EdaO54693 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EdaO54693 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EdaO54693 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EdaO54693 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EdaO54693 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EdaO54693 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EdaO54693 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EdaO54693 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EdaO54693 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EdaO54693 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EdaO54693 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EdaO54693 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EdaO54693 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EdaO54693 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EdaO54693 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EdaO54693 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EdaO54693 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EdaO54693 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EdaO54693 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EdaO54693 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EdaO54693 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EdaO54693 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EdaO54693 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EdaO54693 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EdaO54693 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EdaO54693 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EdaO54693 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EdaO54693 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EdaO54693 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EdaO54693 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EdaO54693 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EdaO54693 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EdaO54693 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EdaO54693 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EdaO54693 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EdaO54693 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EdaO54693 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EdaO54693 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EdaO54693 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EdaO54693 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EdaO54693 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EdaO54693 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EdaO54693 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EdaO54693 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EdaO54693 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EdaO54693 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EdaO54693 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EdaO54693 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EdaO54693 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EdaO54693 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EdaO54693 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EdaO54693 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EdaO54693 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EdaO54693 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EdaO54693 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EdaO54693 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EdaO54693 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EdaO54693 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EdaO54693 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EdaO54693 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EdaO54693 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EdaO54693 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EdaO54693 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EdaO54693 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EdaO54693 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EdaO54693 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EdaO54693 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EdaO54693 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EdaO54693 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EdaO54693 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EdaO54693 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EdaO54693 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EdaO54693 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms