Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nek2O35942 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nek2O35942 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nek2O35942 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek2O35942 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek2O35942 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek2O35942 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek2O35942 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek2O35942 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek2O35942 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek2O35942 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek2O35942 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek2O35942 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek2O35942 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek2O35942 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek2O35942 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek2O35942 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek2O35942 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nek2O35942 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nek2O35942 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nek2O35942 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nek2O35942 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek2O35942 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek2O35942 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek2O35942 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek2O35942 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek2O35942 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek2O35942 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek2O35942 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms