Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pik3cdO35904 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3cdO35904 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3cdO35904 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3cdO35904 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3cdO35904 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3cdO35904 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3cdO35904 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3cdO35904 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3cdO35904 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3cdO35904 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3cdO35904 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3cdO35904 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3cdO35904 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3cdO35904 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pik3cdO35904 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pik3cdO35904 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pik3cdO35904 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pik3cdO35904 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pik3cdO35904 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pik3cdO35904 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pik3cdO35904 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pik3cdO35904 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pik3cdO35904 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms