Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sp100O35892 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp100O35892 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp100O35892 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp100O35892 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp100O35892 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sp100O35892 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sp100O35892 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp100O35892 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp100O35892 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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