Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KeraO35367 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KeraO35367 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KeraO35367 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KeraO35367 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KeraO35367 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KeraO35367 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KeraO35367 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KeraO35367 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KeraO35367 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KeraO35367 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KeraO35367 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KeraO35367 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KeraO35367 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KeraO35367 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KeraO35367 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KeraO35367 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KeraO35367 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KeraO35367 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KeraO35367 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KeraO35367 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KeraO35367 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KeraO35367 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KeraO35367 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KeraO35367 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KeraO35367 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KeraO35367 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KeraO35367 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KeraO35367 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KeraO35367 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KeraO35367 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KeraO35367 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KeraO35367 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KeraO35367 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KeraO35367 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KeraO35367 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KeraO35367 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KeraO35367 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KeraO35367 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KeraO35367 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KeraO35367 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KeraO35367 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KeraO35367 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KeraO35367 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KeraO35367 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KeraO35367 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KeraO35367 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KeraO35367 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KeraO35367 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KeraO35367 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KeraO35367 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KeraO35367 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KeraO35367 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KeraO35367 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KeraO35367 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KeraO35367 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KeraO35367 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KeraO35367 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KeraO35367 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KeraO35367 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KeraO35367 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KeraO35367 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KeraO35367 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KeraO35367 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KeraO35367 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KeraO35367 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KeraO35367 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KeraO35367 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KeraO35367 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KeraO35367 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KeraO35367 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KeraO35367 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KeraO35367 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KeraO35367 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KeraO35367 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KeraO35367 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KeraO35367 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KeraO35367 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KeraO35367 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KeraO35367 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KeraO35367 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KeraO35367 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KeraO35367 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KeraO35367 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KeraO35367 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KeraO35367 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KeraO35367 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KeraO35367 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KeraO35367 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KeraO35367 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KeraO35367 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KeraO35367 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KeraO35367 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KeraO35367 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KeraO35367 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KeraO35367 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KeraO35367 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KeraO35367 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KeraO35367 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KeraO35367 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms