Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ColqO35348 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ColqO35348 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ColqO35348 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ColqO35348 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ColqO35348 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ColqO35348 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ColqO35348 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ColqO35348 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ColqO35348 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ColqO35348 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ColqO35348 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ColqO35348 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ColqO35348 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ColqO35348 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ColqO35348 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ColqO35348 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ColqO35348 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ColqO35348 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ColqO35348 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ColqO35348 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ColqO35348 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ColqO35348 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ColqO35348 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ColqO35348 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ColqO35348 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ColqO35348 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ColqO35348 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ColqO35348 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ColqO35348 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ColqO35348 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ColqO35348 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ColqO35348 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ColqO35348 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ColqO35348 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ColqO35348 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ColqO35348 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ColqO35348 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ColqO35348 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ColqO35348 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ColqO35348 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ColqO35348 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ColqO35348 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ColqO35348 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ColqO35348 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ColqO35348 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ColqO35348 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ColqO35348 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ColqO35348 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ColqO35348 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ColqO35348 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ColqO35348 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ColqO35348 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ColqO35348 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ColqO35348 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ColqO35348 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ColqO35348 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ColqO35348 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ColqO35348 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ColqO35348 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ColqO35348 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ColqO35348 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ColqO35348 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ColqO35348 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ColqO35348 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ColqO35348 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ColqO35348 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ColqO35348 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ColqO35348 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ColqO35348 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ColqO35348 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ColqO35348 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ColqO35348 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ColqO35348 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ColqO35348 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ColqO35348 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ColqO35348 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ColqO35348 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ColqO35348 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ColqO35348 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ColqO35348 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ColqO35348 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ColqO35348 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ColqO35348 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ColqO35348 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ColqO35348 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ColqO35348 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ColqO35348 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ColqO35348 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ColqO35348 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ColqO35348 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ColqO35348 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ColqO35348 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ColqO35348 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ColqO35348 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ColqO35348 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ColqO35348 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ColqO35348 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ColqO35348 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ColqO35348 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms