Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms