Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna4O35343 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna4O35343 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna4O35343 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna4O35343 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna4O35343 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna4O35343 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna4O35343 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna4O35343 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna4O35343 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna4O35343 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna4O35343 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna4O35343 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna4O35343 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna4O35343 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna4O35343 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms