Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d1bO35324 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d1bO35324 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms