Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pkd2O35245 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms