Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Nedd9O35177 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Nedd9O35177 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Nedd9O35177 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Nedd9O35177 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Nedd9O35177 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Nedd9O35177 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Nedd9O35177 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Nedd9O35177 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Nedd9O35177 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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Nedd9O35177 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Nedd9O35177 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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