Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms