Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnk3O35111 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Kcnk3O35111 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Kcnk3O35111 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Kcnk3O35111 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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