Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ArxO35085 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ArxO35085 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ArxO35085 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ArxO35085 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ArxO35085 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ArxO35085 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ArxO35085 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ArxO35085 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ArxO35085 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ArxO35085 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ArxO35085 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ArxO35085 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ArxO35085 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ArxO35085 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ArxO35085 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ArxO35085 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ArxO35085 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ArxO35085 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ArxO35085 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ArxO35085 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ArxO35085 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ArxO35085 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ArxO35085 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArxO35085 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArxO35085 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArxO35085 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArxO35085 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArxO35085 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArxO35085 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArxO35085 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArxO35085 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArxO35085 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArxO35085 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArxO35085 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArxO35085 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArxO35085 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ArxO35085 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ArxO35085 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ArxO35085 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ArxO35085 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ArxO35085 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ArxO35085 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ArxO35085 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ArxO35085 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ArxO35085 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ArxO35085 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ArxO35085 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ArxO35085 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ArxO35085 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ArxO35085 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ArxO35085 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ArxO35085 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ArxO35085 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ArxO35085 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ArxO35085 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ArxO35085 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ArxO35085 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ArxO35085 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ArxO35085 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ArxO35085 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ArxO35085 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ArxO35085 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ArxO35085 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ArxO35085 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ArxO35085 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ArxO35085 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ArxO35085 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ArxO35085 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ArxO35085 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ArxO35085 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ArxO35085 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ArxO35085 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ArxO35085 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ArxO35085 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ArxO35085 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ArxO35085 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ArxO35085 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ArxO35085 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ArxO35085 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ArxO35085 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ArxO35085 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ArxO35085 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ArxO35085 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ArxO35085 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ArxO35085 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ArxO35085 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ArxO35085 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ArxO35085 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ArxO35085 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ArxO35085 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ArxO35085 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ArxO35085 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ArxO35085 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ArxO35085 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ArxO35085 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ArxO35085 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ArxO35085 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ArxO35085 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ArxO35085 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms