Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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H2-Q1O19441 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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H2-Q1O19441 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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H2-Q1O19441 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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H2-Q1O19441 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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H2-Q1O19441 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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H2-Q1O19441 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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H2-Q1O19441 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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H2-Q1O19441 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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H2-Q1O19441 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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H2-Q1O19441 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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H2-Q1O19441 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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H2-Q1O19441 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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H2-Q1O19441 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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H2-Q1O19441 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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