Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms