Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tcof1O08784 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms