Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna5O08543 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna5O08543 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efna5O08543 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efna5O08543 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Efna5O08543 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efna5O08543 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna5O08543 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efna5O08543 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efna5O08543 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms