Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zfp955bL7N232 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp955bL7N232 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms