Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r80L7N1Z3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r80L7N1Z3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms