Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ14

Gm4791, Predicted gene 4791, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4791J3QQ14 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm4791J3QQ14 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm4791J3QQ14 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm4791J3QQ14 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm4791J3QQ14 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm4791J3QQ14 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm4791J3QQ14 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Gm4791J3QQ14 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm4791J3QQ14 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm4791J3QQ14 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm4791J3QQ14 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm4791J3QQ14 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm4791J3QQ14 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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