Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms