Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccer2J3QPU5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms