Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP2

Gm3685, Predicted gene 3685, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3685J3QPP2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3685J3QPP2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms