Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Gm8356J3QPD3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8356J3QPD3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8356J3QPD3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8356J3QPD3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8356J3QPD3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8356J3QPD3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8356J3QPD3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8356J3QPD3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8356J3QPD3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8356J3QPD3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8356J3QPD3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8356J3QPD3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8356J3QPD3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8356J3QPD3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8356J3QPD3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8356J3QPD3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8356J3QPD3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8356J3QPD3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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