Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim18J3QNP2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms