Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a18J3QN01 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms