Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6594J3QM43 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm6594J3QM43 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms