Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms