Protein–RNA interactions for Protein: G3X9V8

Serpinb3a, MCG129038, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb3aG3X9V8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Serpinb3aG3X9V8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpinb3aG3X9V8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms