Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arfgef1G3X9K3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms