Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan2G3X952 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zkscan2G3X952 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zkscan2G3X952 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zkscan2G3X952 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zkscan2G3X952 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zkscan2G3X952 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zkscan2G3X952 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zkscan2G3X952 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zkscan2G3X952 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zkscan2G3X952 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zkscan2G3X952 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zkscan2G3X952 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zkscan2G3X952 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zkscan2G3X952 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zkscan2G3X952 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zkscan2G3X952 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Zkscan2G3X952 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.6 ms