Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SprtnG3X912 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SprtnG3X912 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SprtnG3X912 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SprtnG3X912 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SprtnG3X912 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SprtnG3X912 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SprtnG3X912 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SprtnG3X912 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SprtnG3X912 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms