Protein–RNA interactions for Protein: G3UW87

Gm17455, MCG55969, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17455G3UW87 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17455G3UW87 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms