Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms